Учреждение создано согласно постановлению кабинета министров от 7 сентября 2023 года.
Приоритетной целью центра является улучшение цифровой инфраструктуры системы образования путем разработки и внедрения цифровых решений, — пресс-служба Миобразования
Государственному учреждению поручено в 2024-2027 годах разработать и стать оператором информационных систем:
По распоряжению председателя кабинета министров директором ГУ «Центр цифрового образования» назначен Бектурган Бабаев.