Кто и на каком основании принимает решение о проведении налоговой проверки

И.о. министра финансов приказом от 31 октября 2025 года утвердил Правила и основание принятия решения органом государственных доходов о проведении налоговой проверки и Правила вынесения решения о проведении хронометражного обследования по месту нахождения, сообщает prosud.kz.

Решение органа государственных доходов о проведении налоговой проверки выносится органами государственных доходов в пределах установленных полномочий налоговым законодательством РК:

• Комитета государственных доходов Министерства финансов РК (Комитет);
• департаментов государственных доходов Комитета по областям, городам республиканского значения и столице (Департамент);
• управлений государственных доходов Департамента по районам, городам и районам в городах (Управление).

Комитет принимает решение о проведении налоговой проверки при выявлении нарушений налогового и иного законодательства РК по следующим основаниям и вопросам:

• обращения налогоплательщиков и информации центральных государственных органов РК;
• за ранее проверенный период, за исключением поступивших заявлений, требований, жалоб налогоплательщика (налогового агента) и постановлений, предусмотренных УПК;
• неисполнение мотивированного решения по мониторингу крупных налогоплательщиков;
• несогласие с мотивированным решением по горизонтальному мониторингу по вопросам исполнения налогового обязательства и (или) неисполнение такого решения;
• несоблюдение требований законодательства РК о государственном регулировании производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута;
• трансфертного ценообразования, предусмотренным законом "О трансфертном ценообразовании";
• минимизация налоговых рисков в соответствии с пунктом 2 статьи 93 Налогового кодекса;
• правомерности применения положений международных договоров.

Департаменты принимают решения о проведении налоговой проверки по следующим основаниям и вопросам:

• обращения налогоплательщиков и информации областных и приравненных к ним (городам республиканского значения) государственных органов РК;
• определение налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) проводится досудебное расследование по факту совершения действий по выписке счета-фактуры без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
• определение налогового обязательства по взаиморасчетам с налогоплательщиком (налогоплательщиками), в отношении которого (которых) органом государственных доходов применено приостановление выписки электронных счетов-фактур в соответствии с подпунктом 1) пункта 1 статьи 88 Налогового кодекса;
• подтверждение фактического совершения оборота по реализации товаров, выполнению работ и оказанию услуг;
• подтверждение наличия нарушений, указанных в уведомлении о расхождениях, выявленных по результатам камерального контроля;
• получение сведений по расходованию денег и (или) иного имущества от иностранных государств, международных и иностранных организаций, иностранцев, лиц без гражданства, в отдельных случаях.

Управление принимает решения о проведении налоговой проверкипо следующим основаниям и вопросам:

• обращения налогоплательщиков и информации районных (городских) государственных органов РК;
• наличие товарно-транспортных накладных на импортируемые и перемещаемые между государствами – членами ЕАЭС товары и соответствие наименования товаров сведениям, указанным в товарно-транспортных накладных;
• наличие сопроводительных накладных на товары и соответствие наименования, количества (объема) товаров сведениям, указанным в сопроводительных накладных на товары:

- при перемещении, реализации и (или) отгрузке товаров по территории РК, в том числе осуществляемых международными автомобильными перевозками между государствами – членами ЕАЭС;

- при ввозе товаров на территорию РК с территории государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств – членов ЕАЭС;

- при вывозе товаров с территории РК на территорию государств, не являющихся членами ЕАЭС, и государств – членов ЕАЭС;

• подтверждение наличия остатков товаров, включенных в перечень товаров, к которым применяются пониженные ставки таможенных пошлин в связи с присоединением РК к Всемирной торговой организации;
• наличие документов, предусмотренных нормативными правовыми актами РК, принятыми в реализацию международных договоров при вывозе товаров с территории РК на территорию государств – членов ЕАЭС и соответствия товаров сведениям, указанным в документах;
• наличие и подлинность на товаре средств идентификации по товарам, подлежащим обязательной маркировке в соответствии с международными договорами, ратифицированными РК, и (или) законодательством РК;
• наличие и подлинность средств идентификации и учетно-контрольных марок;
• наличие лицензии;
• постановка на регистрационный учет в органах государственных доходов;
• соблюдение порядка выписки электронных счетов-фактур;
• соблюдение требований налоговой регистрации;
• соблюдение порядка применения контрольно-кассовых машин и (или) трехкомпонентной интегрированной системы;
• наличие контрольно-кассовых машин и (или) трехкомпонентной интегрированной системы;
• наличие оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек;
• соблюдение законодательства РК о разрешениях и уведомлениях и условий производства, хранения и реализации отдельных видов подакцизных товаров.

До вынесения решения о проведении налоговой проверки:

ОГД по обращениям налогоплательщиков и информациям государственных органов осуществляется:

• анализ данных налоговой отчетности, представленной налогоплательщиками, сведений, полученных от центральных уполномоченных государственных и правоохранительных органов, организаций, уполномоченных лиц, а также сведений, указанных в требовании и запросе инициатора проверки на предмет подтверждения нарушений налогового законодательства;
• в случаях неподтверждения нарушений – направление обоснованного ответа в адрес инициатора проверки;
• в случаях подтверждения нарушений налогового законодательства принятие решения органа государственных доходов осуществляется путем:

- вынесения и направления Комитетом решения о проведении налоговой проверки для его исполнения в Департаменты с необходимостью проведения процедуры заслушивания;

- вынесения Департаментами и Управлениями решения о проведении налоговой проверки в пределах установленных полномочий и по территориальности инициатора проверки с необходимостью проведения процедуры заслушивания, предусмотренной статьей 73 АППК.

Комитет формирует списки с направлением их в Департаменты в отношении налогоплательщиков:

• представивших дополнительные декларации за ранее проверенный период;
• имевших взаиморасчеты с налогоплательщиком, в отношении которого проводится досудебное расследование по факту совершения действий по выписке счета-фактуры без фактического выполнения работ, оказания услуг, отгрузки товаров;
• имевших взаиморасчеты с налогоплательщиком, в отношении которого ОГД применено приостановление выписки электронных счетов-фактур в соответствии с подпунктом 1) пункта 1 статьи 88 Налогового кодекса;
• по которым требуется подтверждение фактического совершения оборота по реализации товаров, выполнению работ и оказанию услуг;
• по которым требуется подтверждение наличия нарушений, указанных в уведомлении о расхождениях, выявленных по результатам камерального контроля , за исключением уведомлений по вопросам исполнения налоговых обязательств по подоходному налогу, удерживаемому у источника выплаты с доходов нерезидентов и налогу на добавленную стоимость по обороту по приобретению работ, услуг от нерезидента;
• по которым получены сведения по расходованию денег или иного имущества от иностранных государств, международных и иностранных организаций, иностранцев, лиц без гражданства, в отдельных случаях.

Департаменты по полученным спискам налогоплательщиков проводят процедуру заслушивания.

Комитет выносит решение о проведении налоговой проверки с направлением в Департамент в случаях:

• отклонения цены сделки от рыночной цены и (или) условий сделки от рыночных условий, а также на основании информации о фактах применения трансфертных цен, полученных от государственных органов и отсутствия источников информации по рыночным ценам;
• несоблюдения требований законодательства РК о государственном регулировании производства и оборота отдельных видов подакцизных товаров, а также оборота авиационного топлива, биотоплива, мазута;
• неисполнения мотивированного решения по мониторингу крупных налогоплательщиков; несогласия с мотивированным решением по горизонтальному мониторингу по вопросам исполнения налогового обязательства и (или) неисполнения такого решения;
• правомерности применения положений международных договоров.

ОГД при принятии решения о проведении:

• комплексной налоговой проверки – осуществляет проверку по вопросу исполнения налогового обязательства по всем видам налогов и платежей в бюджет, социальных платежей;
• тематической налоговой проверки – осуществляет проверку по вопросу исполнения налогового обязательства по отдельным видам налогов и (или) платежей в бюджет.

КГД при принятии решения о проведении налоговой проверки учитывает наличие одного из следующих сведений:

• налоговая нагрузка в пределах срока исковой давности нулевая либо ниже среднеотраслевого значения, при этом по комплексным налоговым проверкам налоговая нагрузка составляет не менее 90% верхнего показателя коэффициента налоговой нагрузки по соответствующему виду деятельности и с учетом региона осуществления деятельности;
• несоответствие оборотов по периодам (наличие крупных оборотов по реализации по отдельным годам, при этом в других периодах оборот по реализации нулевой, за исключением сумм, внесенных в качестве взноса в уставный капитал);
• применение льготы по освобождению от уплаты корпоративного подоходного налога (КПН) по деятельности на территории специальных экономических зон, парка инновационных технологий, международного технологического парка);
• взаиморасчеты с поставщиками, по которым ограничена выписка электронного счета-фактуры, судом сделка/регистрация признаны недействительными;
• несоответствие приобретенных и реализованных товарно-материальных запасов;
• правильность применения пропорции по доходам и расходам по совместной деятельности;
• наличие сумм убытка по итогам года (более 40%) от среднего совокупного годового дохода (до корректировок) за предшествующие 3 года;
• не проверенный период по КПН и НДС 4 года и более для крупного предпринимательства и 3 года и более для среднего предпринимательства;
• наличие дебетового сальдо по НДС у налогоплательщика, являющегося уполномоченным экономическим оператором;
• осуществление деятельности по долгосрочным контрактам в течение предшествующих 3 лет;
• наличие отклонений по суммам услуг, полученных от нерезидентов по декларации НДС и сведениям Национального банка по перечисленным суммам в зарубежные страны;
• наличие дебетового сальдо по НДС (свыше 100 миллионов тенге) в течение 2 последующих лет, за исключением экспортеров;
• корректировка сумм доходов по КПН в сторону уменьшения и вычетов в сторону увеличения;
• срок исковой давности у недропользователя истекает менее чем через один календарный год, в части начисления и (или) пересмотра исчисленной суммы налогов и платежей в бюджет;
• наличие у недропользователя убытков по контрактной (одному или нескольким контрактам) и внеконтрактной деятельности на протяжении 3 и более последовательных налоговых периодов;
• неустранение расхождений, указанных в уведомлении, выявленных по результатам камерального контроля.

Сведения, учитываемые органами государственных доходов при принятии решения о проведения налоговой проверки:

• жалоба, в том числе в социальных сетях и видеохостингах, через приложения для мобильных устройств (Whatsap, Facebook, Wipon и другие);
• неустранение нарушений, выявленных ранее проведенными налоговыми проверками по жалобам юридических и физических лиц;
• отсутствие соответствующего регистрационного учета в органах государственных доходов при осуществлении предпринимательской деятельности по сведениям, полученным из различных источников информации;
• отсутствие контрольно-кассовой машины с фискальной памятью (ККМ с ФП) или трехкомпонентной интегрированной системы, а также наличие сведений об использовании ККМ с ФП или трехкомпонентной интегрированной системы не по месту его регистрации в органах государственных доходов по сведениям, полученным из различных источников информации;
• отсутствие оборудования, предназначенного для осуществления платежей с использованием платежной карточки (при обязанности налогоплательщиком устанавливать такое оборудование по сведениям, полученным из различных источников информации;
• отсутствие учетно-контрольных марок и средств идентификации, а также их несоответствие по сведениям, полученным из различных источников информации;
• отсутствие сопроводительных накладных на товары и их несоответствие, а также отсутствие лицензии по сведениям, полученным из различных источников информации;
• отсутствие товарно-транспортных накладных на импортируемые товары, а также их несоответствие по сведениям, полученным из различных источников информации;
• сведения, свидетельствующие о нарушении налогового законодательства РК по несоблюдению применения ККМ с ФП;
• счет-фактура в электронной форме выписана с нарушением сроков, установленных главой 47 Налогового кодекса;
• выявление обстоятельств, свидетельствующих о нарушениях требований органов государственных доходов о приостановлении расходных операций по кассе, по фактам осуществления налогоплательщиком взаиморасчетов с контрагентами, в период действия распоряжения о приостановлении расходных операций по кассе;
• отсутствие сопроводительных накладных на товары, а также их несоответствие наименованиям, количеству товаров сведениям, указанным в сопроводительных накладных на товары;
• наличие сведений о выплате вознаграждений лицам, сообщившим о фактах нарушения налогового законодательства РК по несоблюдению применения ККМ с ФП и оборудования (устройства), предназначенного для приема платежей с использованием платежных карточек;
• неустранение расхождений, указанных в уведомлении, выявленных по результатам камерального контроля.

Приказ вводится в действие с 1 января 2026 года.